攻殻機動隊：SAC_2045 第2季

公安九課的成員搜索一個名叫菲力普·庫庫希金的俄國男人，他似乎知道不少和創造後人類有關的情報

美國特殊作戰軍和公安九課合作，對抗一個冷酷無情、名叫水金鈴鹿的後人類。

調查庫庫希金所知的情報時，公安九課發現驚人資訊，和美國政府開發的人工智慧程式有關。

少佐擔心普琳可能是美方的間諜，於是一群攻殼車開始調查她的過去。

德古沙終於意識到自己被困在記憶裡，隨後卻發現自己突然來到了 2045 年飽受摧殘的東京。

聯絡上德古沙後，巴特等人前往東京。在福岡這邊，少佐得知有個後人類劫走了一艘核子潛艇。

普琳以全身義體化的姿態重生，並試圖搭便車前往東京。美國特殊作戰軍遇上憤怒的水金。

巴特一行人透過史丹德得知後人類事件的最新進展。少佐和普琳與其他人在東京會合。

為了奪回核子潛艇的控制權，公安九課鎖定水金和島村孝。

島村醒過來，情急之下採取了極端行動，讓草薙和隊員陷入兩難困境。

美國企圖實施殲滅計畫，來解決牽涉到「N」的核子危機，草薙和隊員竭盡一切努力阻止。

公安九課回歸日常生活，彷彿一切都沒有發生，唯一發現不對勁的只有草薙。