Chào mừng đến với lớp học đề cao thực lực: Mùa 2

Trong khi đang tận hưởng kỳ nghỉ hè trên một chiếc tàu du lịch sang trọng, Kiyotaka và các học sinh lớp D bất ngờ nhận được thông báo rằng họ sẽ phải trải qua một bài kiểm tra đặc biệt hoàn toàn mới. Lần này, học sinh của bốn lớp sẽ bị xáo trộn và chia thành nhiều nhóm nhỏ.

: Ngày đầu tiên của bài kiểm tra tư duy kết thúc. Nhận thấy sự bất thường và nghi ngờ hành vi của Karuizawa, Kiyotaka đã gặp riêng Suzune để thu thập thêm thông tin về cô lập trưởng này. Cùng lúc đó, Ryuuen tự phụ tuyên bố đã nắm thấu quy luật của bài kiểm tra và đưa ra một lời đề nghị đầy khiêu khích với Suzune.

Chứng kiến Karuizawa đang vô cùng quẫn bách khi bị nhóm nữ sinh lớp C do Manabe cầm đầu liên tục bắt nạt, Yukimura đã định ra tay can thiệp. Tuy nhiên, tình huống này lại vô tình mang đến cho Ayanokouji một cơ hội hoàn hảo để quan sát và thực hiện kế hoạch bí mật của mình.

Học kỳ hai chính thức bắt đầu, đi kèm với đó là giai đoạn chuẩn bị cho đại hội thể thao của trường. Toàn bộ học sinh đều vô cùng lo lắng khi biết thành tích thi đấu sẽ ảnh hưởng trực tiếp đến kết quả của các bài kiểm tra viết sắp tới.

Ayanokouji bắt đầu nảy sinh nghi ngờ đối với Kushida. Cậu chủ động đưa cả Horikita và Kushida đi cùng dưới danh nghĩa thám thính tình hình chuẩn bị của các lớp khác. Tại đây, Horikita đã có những hành động nằm ngoài dự tính của tất cả mọi người.

Đại hội thể thao chính thức khai mạc. Lớp D nhanh chóng rơi vào thế bị động và liên tục gặp bất lợi khi dường như mọi chiến thuật của họ đều đã bị lớp C thấu tóm từ trước. Horikita dần nhận ra có kẻ phản bội đang ngầm rò rỉ thông tin nội bộ.

Sau thất bại ê chề tại đại hội thể thao, bầu không khí ở lớp D trở nên căng thẳng hơn bao giờ hết. Trong khi Horikita cố gắng thay đổi bản thân để kết nối với mọi người, Ayanokouji lại âm thầm sắp xếp các quân bài để chuẩn bị cho bài kiểm tra lớn tiếp theo: Paper Shuffle.

Bài kiểm tra Paper Shuffle đòi hỏi các cặp đôi phải đạt điểm số tối thiểu để không bị đuổi học. Lớp D tiến hành lập chiến lược ra đề để đối đầu trực diện với lớp C. Giữa lúc đó, Kushida một lần nữa ra điều kiện đánh cược với Horikita nhằm trục xuất cô khỏi trường.

Kỳ thi Paper Shuffle chính thức diễn ra với những màn lật kèo cân não về mặt điểm số. Nhờ có sự tính toán thâm sâu từ trước của Ayanokouji, kế hoạch hãm hại của Kushida hoàn toàn gậy ông đập lưng ông, buộc cô ta phải tạm thời chấp nhận thất bại.

Ryuuen gia tăng áp lực lên lớp D nhằm ép kẻ giật dây đứng sau (X) phải lộ diện. Hắn cho người bám đuôi và khủng bố tinh thần các thành viên trong lớp. Cùng lúc đó, Ayanokouji bất ngờ nhận được một cuộc viếng thăm không mong muốn từ người đại diện bên ngoài nhà trường.

Để ép "X" phải ra mặt, Ryuuen và đồng bọn đã bắt giữ Karuizawa Kei lên sân thượng tòa nhà và dùng quá khứ đen tối của cô để tra tấn cô. Bất chấp sự đe dọa, Karuizawa kiên quyết không khai ra danh tính của Ayanokouji vì niềm tin tuyệt đối dành cho cậu.

: Không còn đường lui, Ayanokouji quyết định tự mình xuất hiện trên sân thượng để giải cứu Karuizawa. Tại đây, một trận chiến bạo lực không khoan nhượng đã nổ ra giữa thiên tài phòng trắng và toàn bộ lực lượng nòng cốt của lớp C do Ryuuen dẫn đầu.

Sau khi biến cố trên sân thượng kết thúc, cục diện các lớp có sự thay đổi lớn khi Ryuuen tạm thời lui về thế thủ. Karuizawa nhận ra cảm xúc của mình đối với Ayanokouji đã có bước chuyển biến sâu sắc. Trong khi đó, Sato đã chủ động tiếp cận rủ Ayanokouji đi chơi vào dịp Giáng sinh.