ห้องเรียนลอบสังหาร ซีซั่น 2

ทริปเที่ยวเกาะในฤดูร้อนของห้อง 3-อีกำลังจะจบลง อาจารย์โคโระจัดทดสอบความกล้าเพราะอยากจับคู่จิ้นให้เหล่านักเรียน

คาเอเดะมีแผนจะฆ่าอาจารย์โคโระด้วยระเบิดคัสตาร์ดยักษ์ และขอให้ทุกคนในชั้นเรียนช่วยเธอสร้างระเบิด

อิโตนะลงมือจู่โจมอาจารย์โคโระอีกครั้ง แต่อาจารย์กลับป้องกันตัวได้อย่างง่ายดาย ต่อมาอิโตนะได้ออกอาละวาดล้างแค้นหลังจากที่ชิโร่ทอดทิ้งเขา

อิโตนะใช้ทักษะด้านอิเล็กทรอนิกส์สร้างรถถังบังคับวิทยุเพื่อใช้เล่นงานอาจารย์โคโระ แต่เด็กหนุ่มคนอื่นๆ กลับอยากใช้สิ่งประดิษฐ์ชิ้นนี้ไปแอบส่องใต้กระโปรงสาวๆ

อาซาโนะพบว่าอิโซกาอิ หัวหน้าห้องอีแอบทำงานพิเศษและขู่จะรายงานเรื่องนี้ เว้นแต่ห้องอีจะเอาชนะห้องเอได้ในงานแข่งขันกีฬาโรงเรียน

การฝึกซ้อมฟรีรันนิ่งของห้องอีทำให้ครูชั้นเตรียมอนุบาลคนหนึ่งได้รับบาดเจ็บ อาจารย์โคโระจึงลงโทษทุกคนโดยสั่งห้ามติวสอบกลางภาคและให้ไปทำหน้าที่สอนแทนครูที่บาดเจ็บ

พวกนักเรียนรับบทกามเทพแผลงศร โดยวางแผนให้คาราสุมะมอบดอกไม้ให้อิริน่าในวันเกิด แต่หลังจากคาราสุมะพูดจาแย่ๆ ใส่อิริน่า เธอก็ไม่มาโรงเรียนอีกเลย

คาราสุมะและอาจารย์โคโระพยายามไปช่วยนักเรียน แต่อาจารย์โคโระกลับถูกยมทูตจับขังไว้ ซึ่งบีบให้คาราสุมะและอิริน่าต้องทำการตัดสินใจครั้งสำคัญ

ได้เวลาวางแผนอาชีพ นางิสะไม่แน่ใจว่ายังอยากเป็นนักฆ่าอยู่ไหม ขณะที่แม่ของเขาอยากให้ลูกชายย้ายจากชั้นม. 3 ห้องอี

งานโรงเรียนคุนุกิกาโอกะเป็นสมรภูมิทำเงิน ม.3 ห้องอีขายอาหารที่ใช้ส่วนผสมจากภูเขา แต่ม. 3 ห้องเอก็ทุ่มเทหมดหน้าตักไม่ยอมกัน

สอบปลายภาคใกล้เข้ามาอย่างรวดเร็ว ผู้อำนวยการล้างสมองให้นักเรียนม.3 ห้องเอเกลียดม.3 ห้องอี ส่วนกาคุชูขอให้นักเรียนม.3 ห้องอีเอาชนะม.3 ห้องเอด้วยคะแนน

คาร์ม่าและกาคุชูแข่งกันแก้โจทย์คณิตศาสตร์สุดหินในการสอบปลายภาค จากนั้นถึงเวลาที่ทุกคนจะได้รู้ผลสอบของตัวเอง

อาจารย์โคโระล้มแผนลอบสังหารของผู้อำนวยการอาซาโนะ ทำให้อาซาโนะต้องหันมาทบทวนเส้นทางอาชีพในฐานะอาจารย์ก่อนที่เขาจะต้องเปิดแบบฝึกหัดเล่มสุดท้าย

คาเอเดะโจมตีอาจารย์โคโระขณะทำความสะอาดห้องเก็บของและเปิดเผยความสัมพันธ์ที่คาดไม่ถึงกับอดีตอาจารย์ม. 3 ห้องอีที่ชื่อ ยูคิมูระ อากูริ

นางิสะใช้วิธีแหวกแนวหวังกระตุกขวัญและก่อกวนการโจมตีของคาเอเดะ ดึงความสนใจจากชิโร่ และยื้อเวลาให้อาจารย์โคโระมาช่วยเธอได้ทัน

ยมทูตกับยูคิมูระ อากูริสนิทสนมกันมากขึ้นในแล็บ ส่วนยานากิซาวะมองเห็นผลลัพธ์อันยิ่งใหญ่ในการทดลองของตัวเอง

นางิสะต้องการช่วยอาจารย์โคโระ แต่ทั้งชั้นยังหาข้อตกลงร่วมกันไม่ได้ ส่วนอาจารย์โคโระเสนอให้สะสางข้อขัดแย้งด้วยการเล่นเพนท์บอล

คาร์ม่าและนางิสะคือผู้เล่นสองคนสุดท้ายที่เหลือรอดในการแข่งขันเพนท์บอล และคาร์ม่าได้ขอท้าดวลกับนางิสะแบบตัวต่อตัวเพื่อปิดเกม

ด้วยความช่วยเหลือจากเพื่อนๆ นางิสะ คาร์ม่าและริทสึได้แอบลอบขึ้นไปบนจรวดที่กำลังจะมุ่งหน้าสู่สถานีอวกาศนานาชาติเพื่อค้นหาข้อมูลเกี่ยวกับอาจารย์โคโระ

การสอบเข้ามัธยมปลายกำลังใกล้เข้ามา วันวาเลนไทน์ก็เช่นกัน การพูดคุยกับซากุระทำให้นางิสะครุ่นคิดถึงเส้นทางอนาคตในสายอาชีพครู

อาจารย์โคโระประกาศว่าจะทำหนังสือรุ่นของห้องอีโดยใช้รูปที่เขาถ่ายเอง ส่วนนางิสะได้พูดคุยกับอาจารย์โคโระเรื่องการสอนหนังสือขณะที่เหลือเวลาน้อยลงทุกที

เหลือเวลาอีกสามชั่วโมงก่อนที่เลเซอร์ดาวเทียมต่อต้านอาจารย์จะชาร์จแบตเต็ม ส่วนเด็กๆ ต้องทำภารกิจแฝงตัวเพื่อช่วยอาจารย์โคโระแม้ว่าความหวังจะริบหรี่ก็ตาม

ยมทูตและยานางิซาว่ายังคงโจมตีอาจารย์โคโระอย่างต่อเนื่อง ส่วนคาราสุมะได้พยายามเข้ามาขัดขวางเมื่อยานางิซาว่าพุ่งเป้าโจมตีไปที่เหล่านักเรียน

คาเอดะรอดมาได้ แต่อาจารย์โคโระก็เหนื่อยล้าและอ่อนแรงเต็มที เขาได้ร้องขอบางสิ่งกับนักเรียนม. 3 ห้องอีเป็นครั้งสุดท้าย และเด็กๆ ต้องตัดสินใจว่าจะทำตามหรือไม่

คาราสุมะจัดการให้นักเรียนห้องอีได้เข้าร่วมพิธีจบการศึกษาของโรงเรียนม.ต้นคุนุกิกาโอกะ ก่อนที่ทุกคนจะแยกย้าย นางิสะค้นพบว่าอาจารย์โคโระได้ทำบางสิ่งเพื่อเขาเป็นครั้งสุดท้าย