डार्विन की गुत्थी सीज़न 1

एनिमल लिबरेशन अलायंस, एक आतंकी संगठन एक रिसर्च इंस्टीट्यूट पर हमला करता है और एक गर्भवती चिंपैंज़ी को उठा ले जाता है। पंद्रह साल बाद, उसी रात जन्मा आधा इंसान, आधा चिंपैंज़ी, चार्ली, अब हाई स्कूल में दाखिला लेता है। वह लूसी से दोस्ती करता है, लेकिन दोनों को नहीं पता कि उनकी शांत ज़िंदगी कितने वक़्त तक की है।

एएलए न्यूयॉर्क सिटी में बम धमाके करती है, जिसमें कई लोग मारे जाते हैं।चार्ली के अतीत के एएलए से जुड़े होने की बातें सामने आते ही, शहर के लोग उसके ऊपर शक करने लगते हैं।फिर भी चार्ली रोज़ की तरह स्कूल जाता है, ये जाने बिना कि एएलए ने उसके लिए क्या साज़िश रच रखी है, जबकि एक रहस्यमयी शख्स लूसी के पास पहुँचता है।

लूसी कॉर्नबर्ग प्राइमेट रिसर्च इंस्टीट्यूट में जाती है, जहाँ वो ईवा से मिलती है, वही चिंपैंज़ी जिसने चार्ली को जन्म दिया था। वहाँ डॉक्टर फाउलर उसे चार्ली के जन्म से जुड़े कुछ राज़ बताते हैं।बाद में लूसी चार्ली के परिवार के साथ डिनर करती है, जहाँ हन्ना उसकी पहली दोस्ती का जश्न मना रही होती है, बेख़बर कि एएलए के लोग बाहर घात लगाए बैठे हैं।

चार्ली अचानक गायब हो जाता है। जब बर्ट और हन्ना उसे हर जगह ढूँढ रहे होते हैं, उसी वक़्त चार्ली शांति से एएलए के तीन सदस्यों, रिवेरा, लिपमैन और मिन-सू का सामना कर रहा होता है। वो उन्हें एक आख़िरी चेतावनी देता है, पर तभी रिवेरा एक ख़तरनाक कदम उठा लेता है।

कांग्रेसवुमन डेफ्ने एम. लिनारेस की मदद से चार्ली आख़िरकार हिरासत से रिहा हो जाता है।लेकिन स्कूल लौटने पर उसे वही लोग तानों और नफ़रत से घेर लेते हैं जो पहले उसका स्वागत करते थे।फिर भी लूसी चार्ली को उसके नागरिक अधिकार दिलाने के लिए कदम उठाती है।

चार्ली फिर से वायरल हो जाता है, जब वो ओज़ी और छात्र कार्यकर्ता गारे के बीच की लड़ाई रोकता है।लेकिन गारे उसे धन्यवाद देने के बजाय ये सवाल उठाता है कि चार्ली पशु अधिकारों को लेकर इतना बेपरवाह क्यों है। चार्ली के रवैये से निराश गारे लाइवस्ट्रीम पर अपनी बेबसी जताता है, तभी उसे एक रहस्यमयी निमंत्रण मिलता है।

श्रूज़ हाई में नकाबपोश शूटर द्वारा छात्रों को लाइवस्ट्रीम पर गोली मारते देख पूरा देश दहशत में है।डिप्टी फिलिप ग्राहम स्कूल में घुसते हैं, लेकिन वहाँ उन्हें चार्ली घायल छात्रों को बचाने की कोशिश करते हुए मिलता है।उधर, लूसी का आमना-सामना शूटर से हो जाता है, जो चार्ली के लिए अपना आख़िरी संदेश रिकॉर्ड करना चाहता है।

स्कूल शूटिंग के बाद बढ़े गुस्से के चलते देशभर में वेगन्स और एक्टिविस्टों पर हमले बढ़ने लगते हैं।एएलए-विरोधी भावनाओं के बीच, चार्ली द्वारा शूटर की मदद करने की अफ़वाहें फैलने लगती हैं, जिससे उसके आतंकवादी संबंधों पर शक गहराता है और शहर के लोग उससे भिड़ जाते हैं।

लूसी की मुलाक़ात डिप्टी फिल से होती है और वह उन्हें दस साल पुरानी पूल वाली घटना की सच्चाई बताती है।इससे फिल की चार्ली के बारे में राय डगमगाने लगती है, जबकि हन्ना अपने गोद लिए बेटे में कुछ बदलाव महसूस करती है।उसी रात, लूसी और चार्ली हमेशा की तरह मैसेज करते हैं। लेकिन लूसी के अजीब जवाब से चार्ली को शक होने लगता है।

चार्ली अकेले ही किडनैप की गई लूसी को बचाने निकल पड़ता है।एएलए के हथियारबंद सदस्यों से भिड़ने के बाद, वह रिवेरा के साथ मौजूद लूसी तक पहुँच जाता है।रिवेरा उससे मिलकर बहुत खुश होता है और उसे पंद्रह साल पहले ईवा को बचाने वाली एएलए रेड की सच्चाई और चार्ली के जैविक पिता डॉ. डेविड ग्रॉसमैन का संबंध बताता है।

चार्ली जब लूसी को बचाकर लौटता है, तो पाता है कि उसका घर आग की लपटों में घिरा है। वह अपने माता-पिता को बचाने अंदर भागता है, लेकिन तब तक बहुत देर हो चुकी होती है।उनकी मौत संदिग्ध लगने पर चार्ली पुलिस से बचने के लिए जंगल में गायब हो जाता है।अधिकारियों को पता चलता है कि रिवेरा भी हिरासत से गायब है, जिसके बाद उसकी तलाश शुरू हो जाती है।

अपने माता-पिता को खोने के बाद, चार्ली को डिप्टी फिल और उनकी पत्नी ग्रेस अपने साथ रख लेते हैं।मीडिया के हंगामे और फिल के निलंबन के बावजूद वे साथ में नई ज़िंदगी शुरू करते हैं।लेकिन चार्ली के नए मेडिकल परीक्षणों से पता चलता है कि उसका शरीर एक बदलाव से गुज़र रहा है।

जब चार्ली सामान्य ज़िंदगी में लौटने की कोशिश करता है, तभी एएलए की नई हैवानियत की खबर पूरे देश को दहला देती है।चार्ली इस पर ध्यान नहीं देता और अपनी जैविक माँ ईवा से मिलने जाता है, जो आखिरी साँसें ले रही है।लूसी ईवा को आख़िरी बार बातचीत करने में मदद करती है, और उसके चार्ली के लिए कहे गए आख़िरी शब्द सबको चौंका देते हैं।